La nature du sacrement de la réconciliation consiste en la rencontre personnelle du pécheur avec le Père miséricordieux. L'objet du sacrement est le pardon des péchés, la réconciliation avec Dieu et l'Église et la restauration de la dignité filiale en vertu de la rédemption opérée par Jésus-Christ. L'enseignement de l'Église sur la confession est présenté de manière succincte dans le Catéchisme de l'Église catholique qui, dans le n°1422, reprend le n°11 de Lumen Gentium de Vatican II et le canon 959 du Code de droit canonique.

 Il est essentiel de souligner que le sacrement de la réconciliation, étant un acte de culte, ne peut et ne doit pas être confondu avec une séance psychologique ou une forme de conseil. En tant qu'acte sacramentel, ce sacrement doit être protégé au nom de la liberté religieuse et toute interférence doit être jugée illégitime et préjudiciable aux droits de la conscience.

 Tout ce qui est dit dans la confession, c'est-à-dire depuis le moment où cet acte de culte commence par le signe de la croix jusqu'au moment où il se termine soit par l'absolution, soit par le refus de l'absolution, est sous un sceau absolument inviolable. Toute information donnée en confession est « scellée » parce qu'elle est donnée à Dieu seul, elle n'est donc pas disponible pour le prêtre confesseur.

 L'analogie entre le sceau sacramentel et le secret professionnel auquel sont tenus, par exemple, les médecins, les pharmaciens, les avocats, etc. doit être évitée à tout prix. Le secret de la confession n'est pas une obligation imposée de l'extérieur, mais une exigence intrinsèque du sacrement, et en tant que tel, il ne peut être libéré même par le pénitent lui-même. Le pénitent ne s'adresse pas au confesseur comme à un homme, mais à Dieu. Par conséquent, prendre possession de ce qui appartient à Dieu serait un sacrilège. La protection du sacrement lui-même, institué par le Christ pour être un havre de salut pour tous les pécheurs, y entre. L'approche du sacrement de la confession par les fidèles pourrait s'effondrer si la confiance dans le sceau était perdue, avec des dommages très graves pour les âmes et pour toute l'œuvre d'évangélisation.

 Il est essentiel d'insister sur le caractère incomparable du secret confessionnel par rapport au secret professionnel, afin d'éviter que la législation laïque n'applique au secret confessionnel inviolable des exceptions – pour de justes motifs – au secret professionnel.