20 juin 1792, la populace envahit les Tuileries, château délabré où la famille royale était tenue sous surveillance. Chaque fois qu’on la presse de se retirer, M^me Elisabeth répète : « Je ne quitterai pas le roi. » Quelques furieux la prennent pour la reine, l’entourent et la menacent. Elle reste calme. « Arrêtez, crient les gardes nationaux, ce n’est pas la reine, c’est M^me Elisabeth ! » « Mais ne les désabusez pas ! s’écrie douloureusement la princesse, je la sauverai peut-être ainsi. »  La pique d’un émeutier effleure sa gorge. « Vous ne voudriez pas me faire mal, dit-elle alors avec douceur, alors écartez votre arme. » Les révolutionnaires restent un instant silencieux puis s’éloignent, tête basse. Une femme du peuple s’écrie alors : « Il n’y a rien à faire aujourd’hui, leur S^te Geneviève est là ! »  Pendant son incarcération, bien des geôliers furent retournés par sa noblesse d’âme. Bien qu’étroitement surveillée, elle put, par son ingéniosité, exercer inlassablement sa charité : obtenir en secret le secours d’un prêtre réfractaire à Louis XVI avant son exécution, faire parvenir un colis de linge fin à la reine dans sa cellule, faire que soit épargnée la vie d’une femme noble qui, quoique enceinte, devait être guillotinée avec elle, aider les vingt-trois autres condamnés à mourir l’âme en paix... Le jour de sa mort fut bien le point culminant de sa vie offerte. Elle s’était vêtue de blanc pour aller à la rencontre de son Époux. Sur le passage de la charrette, nulle insulte. Chaque condamné, avant de s’avancer vers la guillotine, vint à ses pieds lui rendre ses derniers hommages et recevoir d’elle son doux encouragement et son beau sourire. Elle s’avança à son tour, en dernier, très calme. Son voile tomba, découvrant son cou, orné d’une médaille de l’Immaculée Conception. « Au nom de votre mère, monsieur, couvrez-moi », intima-t-elle doucement au bourreau. Ce furent ses dernières paroles. Depuis longtemps, elle disait chaque jour cette prière : « Que m'arrivera-t-il aujourd'hui, ô mon Dieu ? je l'ignore. Tout ce que je sais, c'est qu'il ne m'arrivera rien que Vous ne l'ayez prévu de toute éternité. Cela me suffit, ô mon Dieu, pour être tranquille. J'adore vos desseins éternels, je m'y soumets de tout mon cœur. Je veux tout, j'accepte tout, je Vous fais un sacrifice de tout ; j'unis ce sacrifice à Celui de votre cher Fils, mon Sauveur, Vous demandant, par son Sacré-Cœur et par ses mérites infinis, la patience dans mes maux et la parfaite soumission qui Vous est due pour tout ce que Vous voudrez et permettrez. Ainsi soit-il. »